Andrea Baldinotti si è occupato di vari argomenti – soprattutto di pittura toscana dell’Ottocento e del Seicento – e ha curato mostre come Egisto Ferroni e la pittura dei campi (Livorno, 2002) con Vincenzo Farinella, o L’oro delle Apuane (Seravezza, 2007) con Enrico Dei, o ancora Giovanni Martinelli pittore di Montevarchi, maestro del Seicento fiorentino (Montevarchi, 2011) con Riccardo Spinelli e Bruno Santi.
Nel 2002, ha pubblicato il volume Masaccio e Masolino: il gioco delle parti, sull’iconografia degli affreschi della Cappella Brancacci.